635円
いくら良質なデータベースでも、説明が十分でない、利用条件が明確でない、ダウンロードできないなどの理由で十分に利用され、引用され、相応しい評価をうける機会を逃していることがあります。
生命科学系データベースアーカイブは、国内のライフサイエンス研究者が生み出したデータセットをわが国の公共財としてまとめて長期間安定に維持保管し、データ説明(メタデータ)を統一して検索 を容易にすると共に、利用許諾条件などの明示を行うことで、多くの人が容易にデータへアクセスしダウンロードを行えるようにするサービスです (詳細説明)。
データを長期にわたり保全し、データベース作成者のクレジットを明示する一方、公的機関や民間等様々なユーザが利用しやすい形にすることで、それぞれの研究の生命科学へのいっそうの貢献を支援します。 データベースの寄託を随時募集しています(寄託応募要領)。
なお当アーカイブは、Scientific Data誌 の推奨レポジトリ にもなっています。
データベース | データベース運用場所 | 代表者 | データベースカテゴリ | 生物種 | 要約(キーワードを太字表示) | 利用許諾 | |
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データベース | データベース運用場所 | 代表者 | データベースカテゴリ | 生物種 | 要約(キーワードを太字表示) | 利用許諾 | |
NBDC NikkajiRDF
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科学技術振興機構![]() |
- | 化合物 | - | 日本化学物質辞書(日化辞)のデータを化合物情報のRDF記述で標準となっているオントロジーを用いてRDF化したデータベース | CC 表示 詳細 |
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メタゲノム解析用リファレンス16S RNA配列データセット
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広島大学 大学院統合生命科学研究科 ゲノム情報科学研究室 | 坊農 秀雅 | RNA配列データベース | - | Kraken2によるメタゲノムデータ解析で使える16S RNA配列データセット | CC 表示 詳細 |
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jPOSTデータベース
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jPOSTチーム | 石濱 泰 | プロテオミクス | - | jPOSTデータベースは、jPOSTリポジトリに登録されたプロテオームデータに対して統一された基準で再解析した結果を収録したデータベースです | CC0 詳細 |
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LigandBox
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次世代天然物化学技術研究組合![]() |
福西 快文 | 構造データベース-低分子 | - | 計算機によるバーチャルスクリーニング用の低分子化合物のデータベース | CC 表示-継承 詳細 |
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ChemTHEATRE
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愛媛大学 沿岸環境科学研究センター![]() |
仲山 慶 | 化学物質のモニタリングデータ | - | ChemTHEATREは、環境中の化学物質のモニタリング結果を集めたデータベースです。 | CC 表示-継承 詳細 |
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KEGG MEDICUS
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京都大学化学研究所金久研究室![]() |
金久 實 | 疾患、薬剤 | ヒト | 疾患・医薬品・環境物質などのデータを、ゲノム情報を基盤とした生体システム情報として統合したデータベース | CC 表示-継承 詳細 |
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RefEx
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ライフサイエンス統合データベースセンター![]() |
小野 浩雅 | 遺伝子発現 | ヒト・マウス・ラット | 4種類の測定方法による各組織における遺伝子発現状況の数値データのデータベース | CC 表示 詳細 |
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核酸医薬品データベース
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産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター![]() |
福井 一彦 | 核酸医薬品 | - | バイオ医薬品として知られる核酸医薬品の承認薬や、臨床試験における治験段階の情報をまとめたデータベース | CC 表示-継承 詳細 |
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jPOSTリポジトリ
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jPOSTチーム | 石濱 泰 | プロテオミクス | - | 質量分析の生データ、ピークリスト、解析データを登録するためのリポジトリ | CC0 詳細 |
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SPD
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農研機構![]() |
小松 節子 | プロテオミクス関連 | Glycine max | 浸水ストレス下のダイズから得られたプロテオーム、トランスクリプトーム、メタボロームのデータベース | CC 表示-継承 詳細 |
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カイコ参照トランスクリプトームデータ
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- | 横井 翔 | マイクロアレイデータ関連 | Bombyx mori | カイコの新規参照ゲノム配列とカイコP50T系統における複数の器官由来のRNAseqデータから確立した参照トランスクリプトームデータとその関連データ | CC 表示-継承 詳細 |
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GGGenome dataset
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CC 表示-継承 詳細 |
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Yeast Interacting Proteins Database
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東京大学 大学院理学系研究科 生物化学専攻![]() |
伊藤 隆司 | 代謝系/シグナル伝達系パスウェイ-タンパク質相互作用 | 酵母 | Y2Hによる出芽酵母のタンパク間相互作用のデータベース | CC 表示-継承 詳細 |
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DMPD (Dynamic Macrophage Pathway CSML Database)
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東京大学 医科学研究所![]() |
宮野 悟 | 代謝系/シグナル伝達系パスウェイ | ヒト、哺乳類 | マクロファージの分化、活性化に関するパスウェイデータベース | CC 表示-継承 詳細 |
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Arabidopsis thaliana EST index
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かずさDNA研究所![]() |
中村 保一 | cDNA | シロイヌナズナ | シロイヌナズナのEST配列と、それらの配列とNCBI nrデータベースとの間で行ったblastx検索結果。 | CC 表示-継承 詳細 |
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Chlamydomonas reinhardtii EST index
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かずさDNA研究所![]() |
中村 保一 | cDNA | クラミドモナス | クラミドモナスのEST配列と、それらの配列とNCBIのnrデータベースとの間で行ったblastx検索結果。 | CC 表示-継承 詳細 |
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Lotus japonicusEST index
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かずさDNA研究所![]() |
中村 保一 | cDNA | ミヤコグサ | ミヤコグサのEST配列と、それらの配列とNCBIのnrデータベースとの間で行ったblastx検索結果。 | CC 表示-継承 詳細 |
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Trifolium pratense EST index
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かずさDNA研究所![]() |
中村 保一 | cDNA | ムラサキツメクサ | ムラサキツメクサのEST配列と、それらの配列とNCBI nrデータベースとの間で行ったblastx検索結果。 | CC 表示-継承 詳細 |
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生命科学系データベースカタログ
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バイオサイエンスデータベースセンター![]() |
川本 祥子 | カタログ | - | 生命科学系データベースの情報(URL・稼働状況・提供機関・生物種・データ種)を対象や生物種などの項目別に閲覧検索できるカタログ型のデータベース。 | CC 表示-継承 詳細 |
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生命科学系学協会カタログ
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バイオサイエンスデータベースセンター![]() |
川本 祥子 | カタログ | - | 生命科学系学協会の情報(URL・名称・連絡先・会員数・学会誌)を分類別に閲覧検索できるカタログ型のデータベース。 | CC 表示-継承 詳細 |
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施設名辞書
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ライフサイエンス統合データベースセンター![]() |
大久保 公策 | 辞書 | - | 施設名称や研究室名称と、それらの各表記の対応辞書 | CC 表示-継承 詳細 |
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遺伝子名称シソーラス
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ライフサイエンス統合データベースセンター![]() |
大久保 公策 | 辞書 | 9生物種(ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、ショウジョウバエ、線虫、出芽酵母、分裂酵母、枯草菌) | 9生物種(ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、ショウジョウバエ、線虫、出芽酵母、分裂酵母、枯草菌)を対象に遺伝子名、 遺伝子ファミリ名を集め並列関係【同義】および上下関係【ファミリ名】で関係付けました。 頭文字表記や代表的な遺伝子・ゲノムデータベースID情報も名称と扱います。 | CC 表示-継承 詳細 |